Nie stroniąc od zbrodni i przekupstwa Rodrigo Borgia osiąga swój cel – zostaje głową Kościoła katolickiego. Jako papież Aleksander VI kieruje się przede wszystkim chęcią zapewnienia swoim dzieciom – synom Cesare i Juanowi oraz córce Lukrecji pozycji najpotężniejszego rodu w Rzymie. Wykorzystuje też je do umocnienia swojej władzy – zawierania sojuszy i walki z opozycją. Pokonawszy największego wroga, kardynała Della Rovere i zawarłszy rozejm z królem Francji, papież Aleksander VI kontynuuje swoją opartą na intrygach politykę, której celem nadrzędnym jest powiększanie wpływów rodziny.